歷史文化叢書
來到二十一世紀，中國基督教史的研究已進入了關鍵性的階段，探討基督教與社會、文化的互動關係，研究其在中國不同階段的歷史的發展、演變，以及所扮演的角色，尤其在今日現代世俗化及多元化的華人社會中，基督教將具有怎麼樣的特性，這類的研究課題將帶來更深遠的意義。
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目前已出版有：
- 離散中的基督徒身份結構：謝扶雅思想歷程 / 何慶昌著（2013/11）
- 民國福建協和大學之研究：以師資和財務為例(1916-1949) / 彭淑敏著（2013/12）
- 再一解釋：中國天主教史研究方法新拓展 / 吳昶興編著（2014/05）
- 聖母瑪利亞在中國 / 代國慶著（2014/08）
- 被遺忘的中國童年：芝罘學校與內地會傳教士子女 / 張勤瑩著（2014/12）
- 天風的沒落：艾迪對中國共產主義運動的回應 / 鄒朝春著（2015/04）
- 修辭．符號．宗教格言：耶穌會士高一志《譬學》研究 / 林熙強著（2015/11）
- 一個外國傳教士俘虜的長征：成邦慶回憶錄 / 成邦慶著（2016/03）
- 中西並重：監理會在華事業研究(1848-1939) / 馬光霞著（2016/10）
- 「中國之後何處去?」: 中國內地會/海外基督使團（CIM/OMF）和國際傳教運動之全球地域化 / 袁瑒著（2017/08）
- 當代溫州基督教研究 / 舍禾著（2018/01）
- 全球靈恩運動與地方基督教：一種生活史的考察 / 劉義著（2018/07）
- 「溫州教會」領導模式的再思（1867-2015） / 舍禾 著（2019/06）
- 新編基督教在華傳教史 / 裴士丹（Daniel H. Bays）著，尹文涓譯（2019/12）
- 晚雨聖靈：真耶穌教會的再定位與全球五旬節派研究的想像和再現 / 葉先秦著（2020/02）
- 中國加利利的歌聲：迦南詩歌與當代中國家庭教會 / 徐頌贊著（2020/04）
- 他者與我者之間:漢語基督教的本土實踐與跨文化對話/ 徐頌贊著（2021/04）
- 「教會的公僕」──湖南聖經學院簡史(1916-1952)/ 姚西伊著（2021/08）
- 中國西南苗族基督徒與國家（1900-1960）/ 胡其瑞著（2022/04）
- 罪身成義：溫州基督徒的信仰和生活/ 張杰克著（2022/07）
- 大門重開前後的中國教會──良友電台內地聽眾信件研究（1959-1983）/ 吳劍麗著（2022/11）
- 中國億兆：中國內地會與晚清社會(1832-1905)/ 阿爾文‧奧斯汀（Alvyn Austin）著、李楠（Nan Li）譯（2022/11）
- 族群身份與跨國網絡：馬來西亞砂拉越華人基督徒研究/劉計峰著（2023/11）