本所學生畢業後出路主要有四方面，說明如下：

• 攻讀博士學位，可選擇以下博士班繼續深造：神學、聖經研究、宗教學、哲學、歷史、人類學、比較文學、跨文化、族群關係、心理學、社會工作等。
• 教會機構服務：擔任全職傳道或牧職、從事教會、福音機構相關工作。
• 非營利事業組織就業：宗教團體所屬學校之「宗教輔導」教職員、醫院輔導人員（院牧部或宗教關懷師）、宗教機構行政或管理人員。
• 報考公職：宗教行政人員（宗教行政特考、行政特考或高普考）、中小學教師或中學生命教育類科教師（需另修習教育學程，實習後參加教師甄選）